（1）主要研究目标

围绕为林业生产提供良种、为森林遗传多样性保护提供依据为目标，通过加强林木基因组学、转录组学、代谢组学、蛋白质组学等基础研究，解析林木重要性状相关的基因表达与调控的分子机理；采取分子标记技术、转基因技术与常规育种相结合，选育出适于不同环境及不同培育目标的林木良种，并通过研究良种繁育新技术，为林业生产提供更多的良种；通过研究重要树种的群体—个体—细胞—分子等不同层次的遗传变异规律，为遗传改良及遗传多样性保护提供科学依据。

（2）重点研究任务

① 林木遗传改良研究

主要开展杨树、杉木、马尾松、鹅掌楸、银杏等重要树种的生长、木材品质、抗性、药用成分、观赏价值等性状的遗传改良研究。

② 林木基因组研究

从基因组分子水平上研究林木重要基因的结构、功能、表达与调控等。重点解析重要用材树种和经济树种的基因组信息，阐明林木基因的功能及其表达的调控网络系统。

③ 林木分子标记辅助育种研究

以常规育种为基础，开展主要树种重要性状基因的精细定位与克隆、分子标记与表型的相关分析、全基因组的关联分析等研究，建立林木分子标记辅助选择的现代林木分子育种技术，为林木的种质创新、早期选择、遗传型选择等搭建高效的分子育种平台。

④ 林木基因工程和细胞工程研究

开展多个树种安全、高效和无选择性标记的林木转基因体系研究，构建高产、优质、多抗（包括生物逆境和非生物逆境抗性）基因的遗传转化技术平台，通过林木转基因研究创造新种质。

⑤ 林木群体与数量遗传研究

研究森林树种的种内遗传多样性、群体遗传结构、现有分布格局的历史成因等，揭示林木重要经济（数量）性状不同层次变异特点及其遗传规律。开展在人工干涉条件下（包括良种选育），对林木群体的交配系统、遗传分化及其遗传变异的影响研究，为高效定向的林木种质创新与良种选育、林木遗传多样性保护等提供理论依据。